Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF6P49848 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF6P49848 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF6P49848 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF6P49848 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF6P49848 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF6P49848 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF6P49848 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF6P49848 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF6P49848 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF6P49848 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF6P49848 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF6P49848 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF6P49848 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF6P49848 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF6P49848 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF6P49848 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF6P49848 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF6P49848 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF6P49848 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF6P49848 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF6P49848 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF6P49848 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms