Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN2P35609 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms