Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1CAMP32004 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms