Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC27P30260 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC27P30260 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC27P30260 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC27P30260 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC27P30260 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC27P30260 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC27P30260 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC27P30260 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC27P30260 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC27P30260 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC27P30260 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC27P30260 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC27P30260 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC27P30260 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC27P30260 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC27P30260 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC27P30260 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC27P30260 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC27P30260 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC27P30260 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC27P30260 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC27P30260 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC27P30260 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC27P30260 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC27P30260 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC27P30260 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC27P30260 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC27P30260 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC27P30260 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC27P30260 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC27P30260 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC27P30260 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC27P30260 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC27P30260 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC27P30260 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC27P30260 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC27P30260 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC27P30260 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC27P30260 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC27P30260 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC27P30260 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC27P30260 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC27P30260 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC27P30260 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms