Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR1P24390 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms