Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCLP18206 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCLP18206 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCLP18206 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCLP18206 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCLP18206 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCLP18206 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCLP18206 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCLP18206 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCLP18206 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VCLP18206 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCLP18206 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCLP18206 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCLP18206 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VCLP18206 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VCLP18206 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VCLP18206 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VCLP18206 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms