Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAFP15056 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAFP15056 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAFP15056 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAFP15056 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAFP15056 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAFP15056 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRAFP15056 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRAFP15056 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAFP15056 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAFP15056 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAFP15056 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAFP15056 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAFP15056 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAFP15056 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAFP15056 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAFP15056 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRAFP15056 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRAFP15056 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRAFP15056 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRAFP15056 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRAFP15056 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRAFP15056 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRAFP15056 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRAFP15056 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRAFP15056 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRAFP15056 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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