Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT13P13646 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT13P13646 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT13P13646 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT13P13646 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT13P13646 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT13P13646 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT13P13646 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT13P13646 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT13P13646 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT13P13646 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT13P13646 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT13P13646 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT13P13646 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT13P13646 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT13P13646 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT13P13646 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT13P13646 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT13P13646 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms