Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IGKV1-13P0DP09 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms