Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3JO75822 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms