Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPA1O75762 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TRPA1O75762 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms