Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH6O60337 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH6O60337 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms