Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRC1O43663 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRC1O43663 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRC1O43663 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRC1O43663 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRC1O43663 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRC1O43663 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRC1O43663 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRC1O43663 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRC1O43663 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRC1O43663 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRC1O43663 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRC1O43663 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRC1O43663 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRC1O43663 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRC1O43663 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRC1O43663 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRC1O43663 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRC1O43663 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRC1O43663 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRC1O43663 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRC1O43663 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRC1O43663 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRC1O43663 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRC1O43663 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRC1O43663 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRC1O43663 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRC1O43663 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRC1O43663 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRC1O43663 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRC1O43663 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRC1O43663 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRC1O43663 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRC1O43663 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRC1O43663 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRC1O43663 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRC1O43663 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRC1O43663 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRC1O43663 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRC1O43663 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRC1O43663 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRC1O43663 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRC1O43663 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRC1O43663 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRC1O43663 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRC1O43663 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRC1O43663 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRC1O43663 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRC1O43663 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRC1O43663 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRC1O43663 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRC1O43663 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRC1O43663 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRC1O43663 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRC1O43663 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms