Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXO3O43524 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXO3O43524 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms