Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC5O15511 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC5O15511 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC5O15511 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC5O15511 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC5O15511 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC5O15511 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC5O15511 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC5O15511 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC5O15511 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC5O15511 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC5O15511 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARPC5O15511 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms