Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

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Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CUX2O14529 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CUX2O14529 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CUX2O14529 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CUX2O14529 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CUX2O14529 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
CUX2O14529 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CUX2O14529 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CUX2O14529 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CUX2O14529 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CUX2O14529 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CUX2O14529 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CUX2O14529 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CUX2O14529 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CUX2O14529 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CUX2O14529 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CUX2O14529 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CUX2O14529 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CUX2O14529 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CUX2O14529 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CUX2O14529 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CUX2O14529 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CUX2O14529 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CUX2O14529 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CUX2O14529 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CUX2O14529 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CUX2O14529 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CUX2O14529 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CUX2O14529 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CUX2O14529 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CUX2O14529 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CUX2O14529 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CUX2O14529 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CUX2O14529 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CUX2O14529 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CUX2O14529 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CUX2O14529 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CUX2O14529 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CUX2O14529 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CUX2O14529 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CUX2O14529 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CUX2O14529 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CUX2O14529 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CUX2O14529 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CUX2O14529 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CUX2O14529 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CUX2O14529 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CUX2O14529 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CUX2O14529 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CUX2O14529 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CUX2O14529 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CUX2O14529 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CUX2O14529 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CUX2O14529 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CUX2O14529 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CUX2O14529 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CUX2O14529 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CUX2O14529 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CUX2O14529 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CUX2O14529 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CUX2O14529 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
CUX2O14529 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
CUX2O14529 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
CUX2O14529 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CUX2O14529 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CUX2O14529 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CUX2O14529 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CUX2O14529 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CUX2O14529 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CUX2O14529 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CUX2O14529 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CUX2O14529 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CUX2O14529 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CUX2O14529 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CUX2O14529 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CUX2O14529 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CUX2O14529 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CUX2O14529 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CUX2O14529 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CUX2O14529 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CUX2O14529 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
CUX2O14529 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CUX2O14529 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
CUX2O14529 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CUX2O14529 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CUX2O14529 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
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