Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLRMTO00411 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms