Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm28038F7BCN9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm28038F7BCN9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm28038F7BCN9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm28038F7BCN9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm28038F7BCN9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm28038F7BCN9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm28038F7BCN9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm28038F7BCN9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm28038F7BCN9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28038F7BCN9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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