Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E5RI56 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E5RI56 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E5RI56 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E5RI56 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E5RI56 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E5RI56 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E5RI56 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E5RI56 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E5RI56 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E5RI56 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E5RI56 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E5RI56 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E5RI56 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E5RI56 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E5RI56 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E5RI56 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E5RI56 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E5RI56 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E5RI56 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E5RI56 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E5RI56 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E5RI56 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E5RI56 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E5RI56 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E5RI56 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E5RI56 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E5RI56 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms