Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4E1Z4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
B4E1Z4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
B4E1Z4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
B4E1Z4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4E1Z4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4E1Z4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4E1Z4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4E1Z4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
B4E1Z4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4E1Z4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4E1Z4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4E1Z4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4E1Z4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4E1Z4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4E1Z4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4E1Z4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4E1Z4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4E1Z4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4E1Z4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4E1Z4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4E1Z4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4E1Z4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4E1Z4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4E1Z4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4E1Z4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms