Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NEURL1BA8MQ27 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms