Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL13PA6NNM8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms