Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms