Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS37CA5D8V6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms