Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms