Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FARP1Q9Y4F1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms