Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SSX2IPQ9Y2D8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2IPQ9Y2D8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms