Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPG7Q9UQ90 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPG7Q9UQ90 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPG7Q9UQ90 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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