Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG5Q9UPR3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG5Q9UPR3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms