Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHTF1Q9UMS5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHTF1Q9UMS5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms