Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW0

TPX2, Targeting protein for Xklp2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPX2Q9ULW0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TPX2Q9ULW0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPX2Q9ULW0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms