Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PADI1Q9ULC6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PADI1Q9ULC6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PADI1Q9ULC6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PADI1Q9ULC6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms