Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF20Q9UGU0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms