Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTNNAL1Q9UBT7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNAL1Q9UBT7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms