Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms