Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD3Q9P035 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms