Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms