Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDAP2Q9NXN4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms