Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A12Q9NXJ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms