Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED29Q9NX70 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms