Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM161AQ9NX61 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM161AQ9NX61 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM161AQ9NX61 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM161AQ9NX61 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM161AQ9NX61 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM161AQ9NX61 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM161AQ9NX61 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms