Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms