Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL17Q9NRX2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL17Q9NRX2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms