Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMYD2Q9NRG4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMYD2Q9NRG4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms