Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms