Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms