Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-5Q9HDB9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-5Q9HDB9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-5Q9HDB9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms