Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KIAA1549Q9HCM3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms