Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POPDC2Q9HBU9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC2Q9HBU9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms