Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKRIP1Q9H875 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms